除铁锰过滤器的工作原理，地下水除铁锰过滤器是利用滤料表面活性滤膜的催化作用，当曝气含氧水流经过砂滤层时，由于滤料的接触催化作用，水中的铁、锰离子开始氧化，使水中的铁锰离子在滤料表面形成含有结晶水的活性氧化膜，依靠物理截留吸附作用去除。除铁锰过滤器设备利用深井水余压射流曝气，不再增设曝气设备，工作稳定可靠。曝气的作用是增加水中的溶解氧，同时驱除CO2，提高水的PH。
滤料有石英沙和天然锰沙滤料两种，前者使用于含铁量在10mg/L以下，锰含量较小，PH值在6.8以上的原水。后者适用于含铁量在20mg/L以下，锰含量较高，PH值在6以上的原水