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生命科学应用(例如生物信息学、分子动力学和量子化学)非常适用NVIDIA GPU大规模并行架构。如下图所示,在VMD 和分子动力学软件包(如 NAMD 和 HOOMD)上的工作效果。
AMBER Generalized Born模拟
S圣地亚哥 超级计算中心 GPU 集群上 NAMD 扩展效果
UIUC 理论&计算生物物理事业部
Tesla® GPU 为生物物理学家和计算化学家提供了强有力的工具,推动生物化学研究进程,优化可选工作流,加速科研步伐。
使用 CUDA 的关键生命科学应用
ISV 描述
BarraCUDA 序列映射软件
GPU-BLAST 快速 k-tuple heuristic 本地搜索
AMBER 程序套装在生物分子上模拟分子动力学
LAMMPS 典型分子动力学包
NAMD 专为大型分子系统的高性能模拟而设计
Gaussian 能量、分子结构和振动频率预测
TeraChem 量子化学软件,在 NVIDIA GPU 上运行
VASP 基于量子理论的电子结构计算行为
VMD 3D 可视化和分析大型生物分子系统
BarraCUDA 序列映射软件
GPU-BLAST 快速 k-tuple heuristic 本地搜索
