除铁器现有运行控制方式有两种：一是选择现场就地手动控制模式，二是中控室启动流程远程自动控制模式。正常工作情况下，除铁器的运行被置于自动控制模式。其运行控制方式为：
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除铁器启动控制

除铁器的启动随其所在皮带机启动运行，皮带机启动，其高压控制柜内合位继电器上的一对常开触点接通，除铁器得到运行指令开始运转。

除铁器停止控制

除铁器所在的皮带机停止，皮带机控制柜上的合位继电器失电，常开触点断开；除铁器设置延时停机功能，在合位继电器失电后延时10min，除铁器停止运转。