生物质能当前面临的较大问题是难以集中利用，回收和运输的成本极高。我国生物质原料数量虽然巨大，但来源较为分散，与西方农场化耕作模式有较大差别，需建立一套科学合理的收集体系。

　　生物质燃料的原料主要是农林业废弃物，存在着季节性强、收集运输困难的问题。收集生物质能要打“游击战”，可以给农民发放机具，以便同时完成粮食收割和秸秆回收两道作业。在农村，生物质能源可以采用就近收集、就近使用、辐射周边的分散模式。

我国是农业大国，发展生物质能发电是一个不错的选择，然而在利用生物质能发电形成产业化的过程中却存在的一些难题，还有很长的路要走。

总体上看，我国生物质发电产业化尚处于起步阶段，产业化和商业化程度较低，效益不乐观，市场竞争较弱，主要处在一下一些问题是：

1、建设和运营成本相对较高，上网电价难以支撑生物质能发电厂的正常运营 。

2、技术开发能力和产业体系较薄弱;。

3、存在盲目上马问题。目前，有些省份已出现了一个县、市布点多个生物质发电项目的或规划多台机组的问题，造成资源浪费。

生物质发电技术主要是利用农业、林业和工业废弃物为原料，也可以将城市垃圾作为原料，采取直接燃烧或气化的发电方式。生物质发电的技术路线主要有秸秆直燃发电、煤与秸秆混燃发电、秸秆气化发电。