有机肥的生产工艺主要是将含水量低于60%的有机固体废弃物与辅料（植物秸秆等）、微生物发酵菌剂等混合匀匀，通过池式好氧连续发酵使其充分腐熟、除臭、去水。腐熟后的物料水分含量一般在30－35%范围内，经筛选和磁选后可直接用于造粒生产圆球型有机肥，或经过进一步干燥生产粉状有机。
造粒工艺流程
复合肥的工艺流程可分为：原料配料、原料搅拌、原料造粒、颗粒烘干、颗粒冷却、颗粒分级、成品包膜、后成品包装。
1、原料配料：
尿素、硫铵、磷铵（磷酸一铵、磷酸二铵、重钙、普钙）、氯化钾（硫酸钾）等原料按比例配备（根据市场需求和各地土壤检测结果）。
2、原料搅拌：
将配好的原料搅拌均匀进而提gao肥料颗粒整体的均匀肥效含量。
3、原料造粒：
将搅拌均匀的原料送入造粒机造粒（可用转股造粒，也可选用挤压造粒）.。
4、颗粒烘干：

将造粒机造好的颗粒送入烘干机，将颗粒内含的水分烘干，增加颗粒强度，便于保存。

5、颗粒冷却：
烘干后的肥料颗粒温度过高，易结块，经过冷却后的，便于装袋保存，和运输。
6、颗粒分级：
将冷却过后的颗粒分级，不合格的颗粒经粉碎重新造粒，把合格的产品筛分出来。
7、成品薄膜：
将合格的产品进行涂衣包膜增加颗粒的亮度与圆润度。
8、成品包装：
将膜的颗粒也就是成品装袋放在通风处保存。