我国矿泉水和纯净水多使用紫外线、超滤和臭氧作为抑菌菌和消毒和杀菌设施。但多年的经验证明前两种可靠性差，是造成产品不合格的主要因素，而采用臭氧杀菌被认为是目前较好的方法。定期加强对生产全程的管道，容器和过滤器等有关设施的清理和消毒，做好瓶、盖和灌装间的消毒工作。据了解多数厂家的管道和包装物的消毒采用二氧化氯(ClO2)，该药物具有很强的氧化和消毒作用，但要加强对药物的质量监控，保证其消毒效果。

述流传甚广的微信还有个观点：因纯净水矿物盐含量和硬度都近于零，处于“饥饿”状态，具有极强的溶解能力，饮用纯净水不仅不能带来营养，相反还会将体内的部分营养元素溶解，排出体外。“喝纯水不存在任何‘缺营养’的问题。我国大规模推广饮用纯净水已有十多年了，没有发现任何喝纯水后出现不良反应的病例。”顾久传介绍说。
一般情况下纯净水在生产过程中，纯净水源水只有50%-75%被利用，也就是说，1公斤自来水或地下水大约只能生产出0.4公斤左右的纯净水，而剩下的0.6公斤左右的水不能当作饮用水，只能另作它用。反渗透技术是将原水经过精细过滤器、颗粒活性碳过滤器、活性碳过滤器等,再通过泵加压,利用孔径为1/10000μm(相当于大肠杆菌大小的1/6000,病毒的1/300)的反渗透膜(RO膜),使较高浓度的水变为低浓度水,同时将工业污染物、重金属、病毒等大量混入水中的杂质全部隔离，从而达到饮用规定的理化指标及卫生标准。反渗透设备应用膜分离技术，能有效地去除水中的带电离子、无机物、胶体微粒及有机物质等。