软件著作权的申请中，源代码是非常重要的一部分。软件的源代码是程序员根据设计文档和需求分析，按照一定的编码规范对计算机程序进行编写所得到的代码，也是软件的原创性作品。因此，在提交申请时，源代码的要求非常严格。
要求如下:
1、源代码必须是完整的、可读的。
2、源代码必须是可以被编译器正确编译的。
3、源代码必须可以被他人正确地使用。
4、源代码中的注释必须清晰准确。应当在注释中标注程序、日期、版本号等信息。
在软著源码申请过程中，有时候会遇到以下问题：
1、软件的功能不够独特:打破行业惯例，创新设计软件功能，或者将其他浅显易懂的功能整合进来。
2、软件源代码质量太差: 每个文件必须有规划逻辑、注释说明、变量名具有可读性等等。
3、软件说明书缺失或过于简略:软件说明书是软著申请的必要材料，需要提供详细的编写和操作说明。
如果您已经提交了软著申请，但被否决了，建议您处理好申请材料中存在的问题，再次申请，以获得软著的保护。