济源企业想要顺利通过水污染防治工程设计乙级资质审核，可以按照以下步骤和注意事项进行操作：

### 1. 明确资质标准与要求
- 详细了解国家和河南省当前最新的水污染防治工程设计乙级资质的审核标准和条件，包括但不限于企业注册资本、技术人员配备、业绩要求、质量管理体系等方面的规定。

### 2. 企业基本条件准备
- 确保企业具有合法有效的法人营业执照，注册资本达到规定额度，有稳定的办公场所和设计工作所需的技术装备。
- 建立并执行完善的质量管理体系，可以参考GB/T 19001等体系标准建立质量管理体系，并通过认证。

### 3. 人员配备与资质证明
- 按照乙级资质标准配备足够的专业技术人员，包括注册环保工程师、注册结构工程师、注册给排水工程师等，并确保他们都具备有效的资格证书。
- 技术负责人需具备相应的学历、职称和从业经验要求，如5年以上环保工作经验，中级以上职称或注册环保工程师资格。
- 提供所有技术人员的劳动合同、社保缴纳证明，以及他们在本行业的从业经历和业绩证明。

### 4. 项目业绩积累
- 积极参与并完成水污染防治工程设计项目，保留完整的项目档案，包括设计合同、设计方案、施工图、验收报告等，以证明企业具有实际设计能力。

### 5. 材料准备与申报
- 准备齐全且规范的申报材料，包括资质申请表、企业基本情况介绍、各类人员证明材料、工程业绩材料、质量管理体系文件等。
- 申请材料要真实、完整，格式符合要求，并按照规定的渠道和时间节点提交至济源市住房和城乡建设局或相关生态环境部门。

### 6. 申报流程跟进
- 申报后积极配合主管部门的审查工作，包括资料审核、现场考察等环节。
- 若审查中有任何问题，应及时补正材料或作出合理解释。

### 7. 保持沟通与学习
- 保持与行业主管部门、行业协会等的沟通交流，及时了解政策动态和行业资讯，参加相关培训，不断提升企业的技术水平和服务能力。

总之，要顺利通过水污染防治乙级资质审核，企业不仅要在硬性条件上达标，还要在人员素质、项目业绩、质量管理等方面表现出较强的实力和良好的信誉。同时，注重申报过程的规范化和严谨性，确保申报工作顺利进行。