代理理论则将信息经济学方法用于单人决策的情形发展到用于多人决策的情形，将会计信息视为委托人、代理人之间订约的基础；将企业不再视为单一的组织机构，转而认同与企业签约的代理人有不同利益、信息和理念。管理会计信息系统通过提供信号（如实际后果、不同状态发生的可能性、代理人的行动和努力程度）服务于委托人和代理人。但目前代理理论还只能应用于相当简单的组织环境（由于计算均衡结果的复杂和困难），其代理人不愿劳动和不努力的假设，至少对经理人而言是不公正的，因为经理人并非厌恶劳动或更愿意损害企业利益，这种静态技术的假设忽略了知识和革新对企业价值增值的作用。
剩余利润指标由通用电气公司（General Electric Corporation）首创，用来鼓励部门经理进行低于本部门平均ROI指标，而收益超过其资本成本并有利于公司总的ROI增长的投资。但也许是商业文化传统的影响，剩余利润指标没有能在实务上广泛使用，即使是通用电气公司后来也弃用剩余利润指标，重新使用ROI指标作为投资中心财务业绩评价的基本标准。
折现的现金流量法虽然在理论上优于非折现的投资回收期法和会计收益率法等传统方法，但对于许多投资而言不符合成本效益原则，在企业如何实施仍是难以解决的问题，更何况未来的现金流量本身就很难确定，实务上更多的是采用非折现的投资回收期法。折现的现金流量法虽然在理论上优于非折现的投资回收期法和会计收益率法等传统方法，但对于许多投资而言不符合成本效益原则，在企业如何实施仍是难以解决的问题，更何况未来的现金流量本身就很难确定，实务上更多的是采用非折现的投资回收期法。