碳源是反消化过程不可少的一种物质。传统的碳源物质包括甲醇、乙酸和一些低分子糖类等，甲醇、乙酸等小分子液体碳源反硝化作用率高，脱氮效果好，但其投加量不易控制，运输和运行成本较高，具有一定的毒性和危害。研究者对外加碳源问题进行了新的探索和尝试研究，开始探索开发新型外加碳源来代替传统碳源。

醋酸钠：醋酸钠的优势取决于它能马上响应反硝化全过程，能用作水厂运行时的紧急处理。糖类：碳源充足的情况下，以葡萄糖为碳源的较好碳氮与以甲醇为碳源的情况相比非常高，为 6:1~7:1。淤泥水解上清液：生物转化 VFA 来自污泥水解反应的上清液，因为水解反应所造成的 VFA 有着很高的反硝化速度，碳源能够立即由污水处理厂內部出示，在污泥减容的一起还降低了碳源运送层面的难题，因此这是现阶段较为有优点的碳源。