在热水循环时，如果杀菌锅桶体较长，各点距离较长，为了使热水流向更均匀，采用不锈钢管为导向，在管的一面打有出水小孔，（小孔呈梅花状管截面积是小孔截面积的1.2倍），考虑到水的阻力，管孔以先小后大的方式，此锅内热水隔一段时间左右循环一次。

杀菌锅在升温时几分钟就可以达到预定温度，在升温过程中，随着温度的升降和恒温时温度少许变化，蒸汽薄膜调节阀门进行蒸汽输入量的调节，以确保温度不会发生反冲。（此蒸汽薄膜调节阀通过温度一体化变送器输出4-20mA电流的信号输入到PLC编程内,进行不间断的关、启调节，直至后关闭。）蒸汽薄膜调节阀随着温度的变化而调节。

保压时，通过一体化压力变送器进行自动保压。可首先设定好锅内压力，压力高时自动排出，压力低时自动补压。杀完菌后，把锅内热水通过水泵打到上罐。杀菌锅在降温时开启降温循环泵，并设有溢流阀，在杀菌锅长时间使用时，可以通过溢流阀把锅内部分热水排出，以确保在短时间内使锅内产品冷却到所设定的温度。