尽管与传统模具相比，模内热切模具有许多显著的优点，但模具用户亦需要了解模内热切模具的缺点。概括起来有以下几点。
1.模具成本上升
模内热切元件价格比较贵，模内热切模具成本会大幅度增加。如产品附加值较低，产品产量不高，对于模具厂商来说经济上不划算。对许多发展中国家的模具用户，模内热切系统价格贵是影响模内热切模具广泛应用的主要问题之一。
2.模内热切模具制作工艺设备要求高
模内热切模具需要精密加工机械作保证。模内热切系统与模具的集成与配合要求极为严格，否则模具在生产过程中会出现很多严重问题。 如模具油缸安装孔平面加工粗糙密封件无法封油导致油缸无法运动，切刀与模仁的配合不好导致切刀卡死无法生产等。
3.操作维修复杂
与模内热切模具相比，模内热切模具操作维修复杂。如使用操作不当极易损坏模内热切零件，使生产无法进行，造成巨大经济损失。对于模内热切模具的新用户，需要较长时间来积累使用经验。 

五、 模内热切系统的组成
尽管世界上有许多模内热切生产厂商和多种模内热切产品系列，但一个典型的模内热切系统均由如下几大部分组成：
1. 微型超高压油缸
2.高速高压切刀
3. 超高压时序控制系统
4. 辅助零件