对于已在管道壁上形成的老垢层，主要垢分子(CaCO3、CaSO4等)通过分子间的作用力结合在一起，以网状结构或方解石结构的形式附着在管道内壁上，通过变频高频电磁场作用后，水分子的偶极矩增大，极性增强，水分子处于较高的能量状态，它能有效地削弱垢分子之间的分子作用力及其与管壁的附着力，使垢层逐渐软化、龟裂，直至脱落，达到除垢效果。

变频高频电磁场，可在水体中激活大量的自由电子，能有效防止管道内壁的金属原子失去电子被氧化，并能有效地破坏引起管道腐蚀的微电池效应，从而起到了防止管道氧化和腐蚀的作用。

根据不同的水质适应不同频率的高频来处理的原理，水始终在同频的高频电磁场的作用下发生共振，原来大缔合状态的结合键被深度打断，离解成活性很强的单个水分子或小缔合体状态水，改变了水的物理结构与特性，增强了水分子的极性，增大了水分子的偶极矩，溶解在水中的盐类正负离子，被单个水分子包围，运动速度降低，有效碰撞次数减少，在管壁上无法成垢，从而达到防垢的目的。