次氯酸钠消毒最主要的作用方式是通过它的水解形成次氯酸，次氯酸再进一步分解形成新生态氧，新生态氧的极强氧化性使菌体和病毒上的蛋白质等物质变性，从而致死病源微生物。
次氯酸钠发生器一般由化盐装置、电解装置、整流设备、配兑水系统、自控装置和储药液箱等几大部分组成。次氯酸钠发生器设备的核心部分——电解装置，是由一组涂有铂、钌、铱、铑等稀有金属纳米涂层的特种金属材料做阳极，耐腐蚀的特种金属材料做阴极，组成密闭的电解槽容器。并且，次氯酸钠消毒设备的电解槽内部设有反冲洗系统和冷却系统。
化盐装置、储药液箱、配水系统、酸洗装置等各个分体设备全部采用特定制作的PTF高强度复合材料制造，极不同于易于老化的PVC材料制作；次氯酸钠生成器(电解槽)为不锈钢外壳，内贴高级复合材料。整套设备高级防腐、强抗老化、经久耐用。设备质量达到国际一流，可完全保证二十年以上的正常使用寿命。
次氯酸钠发生器消毒设备具有人工电钮控制和工业计算机控制两种系统可选。工业计算机控制设备具备高度自动化功能，触摸屏设置，完全将设备运行中产生的水垢酸洗过程和药物投加系统等全部纳入电脑自动化控制。 次氯酸钠发生器具有自检自测功能，全自动加药，24小时无故障运行，还可实现远程监控，达到国际一流技术水平。生成量为3Kg/h有效氯以上的较大型次氯酸钠发生器设备主要采用工业计算机控制整个设备的运行。各种次氯酸钠消毒设备均可根据用户需要优化设计、制造。