电子水处理仪主要是通过主机高频信号发生器对流经辅机管内的水施加一高频电磁场，使水的物理结构及性质发生变化，来达到防垢、除垢、防腐蚀的功能。

水在高频电磁场的作用下，原来链状大分子可断裂成单个水分子，使其活性增强。而含在水中的碳酸盐类、非碳酸盐类的离子(正离子和负离子)被单个分子包围，运动速度降低，有效碰撞次数减少，无法生成水垢成分，使其水的分子结构发生变化，从而改变其垢分子的成分而达到防垢的目的。

电子水处理仪可用于热水采暖系统中，循环系统中，电子水处理仪多安装在锅沪出水总管附近。因经过水处理仪的水，其有效作用时间不长，所以当采用间歇供暖时，循环水泵不宜停运，以避免系统中的水置放时间较长时，其电子水处理仪作用逐渐减弱。